Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Capn13Q3UW68 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Capn13Q3UW68 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms