Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Slfn4Q3UV66 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slfn4Q3UV66 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms