Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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BB287469Q3UT53 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BB287469Q3UT53 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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BB287469Q3UT53 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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BB287469Q3UT53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BB287469Q3UT53 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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