Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Syndig1lQ3USQ7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Syndig1lQ3USQ7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms