Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fchsd2Q3USJ8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fchsd2Q3USJ8 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms