Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm28047Q3US59 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm28047Q3US59 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms