Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp560Q3URI6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms