Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cobll1Q3UMF0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cobll1Q3UMF0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms