Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc33Q3ULW6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms