Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ctsll3Q3ULP7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ctsll3Q3ULP7 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Ctsll3Q3ULP7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ctsll3Q3ULP7 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms