Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc106Q3ULM0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc106Q3ULM0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms