Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Edc4Q3UJB9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Edc4Q3UJB9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms