Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sf3b2Q3UJB0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms