Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rnf224Q3UIW8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rnf224Q3UIW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms