Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lmod2Q3UHZ5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Lmod2Q3UHZ5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms