Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rnf44Q3UHJ8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rnf44Q3UHJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms