Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pitpnm3Q3UHE1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms