Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nom1Q3UFM5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nom1Q3UFM5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms