Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Puf60Q3UEB3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Puf60Q3UEB3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms