Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trafd1Q3UDK1 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Trafd1Q3UDK1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms