Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBX0

Tmem109, Transmembrane protein 109, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem109Q3UBX0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem109Q3UBX0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem109Q3UBX0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms