Protein–RNA interactions for Protein: Q3UAW9

Brf2, Transcription factor IIIB 50 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf2Q3UAW9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Brf2Q3UAW9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Brf2Q3UAW9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms