Protein–RNA interactions for Protein: Q3U5F4

Yrdc, YrdC domain-containing protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YrdcQ3U5F4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
YrdcQ3U5F4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
YrdcQ3U5F4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms