Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Palb2Q3U0P1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Palb2Q3U0P1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms