Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hace1Q3U0D9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms