Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Srsf6Q3TWW8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms