Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc136Q3TVA9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc136Q3TVA9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms