Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Fbxw18Q3TSA9 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Fbxw18Q3TSA9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms