Protein–RNA interactions for Protein: Q3TS39

1700066B19Rik, RIKEN cDNA 1700066B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700066B19RikQ3TS39 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700066B19RikQ3TS39 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700066B19RikQ3TS39 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms