Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tmem38aQ3TMP8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms