Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Smarca4Q3TKT4 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Smarca4Q3TKT4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms