Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp39Q3TIX9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp39Q3TIX9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms