Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Jmjd8Q3TA59 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Jmjd8Q3TA59 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Jmjd8Q3TA59 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms