Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Hddc2Q3SXD3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms