Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nell1Q2VWQ2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nell1Q2VWQ2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms