Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trim71Q1PSW8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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