Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Myo3bQ1EG27 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Myo3bQ1EG27 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms