Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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Rpusd3Q14AI6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rpusd3Q14AI6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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