Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Rpusd2Q149F1 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rpusd2Q149F1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rpusd2Q149F1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rpusd2Q149F1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
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Rpusd2Q149F1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Rpusd2Q149F1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rpusd2Q149F1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rpusd2Q149F1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms