Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Itgb8Q0VBD0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms