Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T8

Cntnap5b, Contactin-associated protein like 5-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5bQ0V8T8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cntnap5bQ0V8T8 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
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