Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Vps8Q0P5W1 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Vps8Q0P5W1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms