Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Neurl1bQ0MW30 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms