Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Pate4Q09098 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms