Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ssrp1Q08943 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ssrp1Q08943 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms