Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Hoxc4Q08624 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Hoxc4Q08624 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms