Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tgm3Q08189 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tgm3Q08189 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms