Protein–RNA interactions for Protein: Q08093

Cnn2, Calponin-2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn2Q08093 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnn2Q08093 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cnn2Q08093 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms