Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
MestQ07646 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MestQ07646 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MestQ07646 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MestQ07646 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
MestQ07646 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
MestQ07646 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
MestQ07646 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
MestQ07646 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
MestQ07646 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms