Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Col9a2Q07643 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Col9a2Q07643 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms